Ercole Procaccini nasce a Bologna nel 1515.
Ebbe importanti incarichi nella Compagnia dei Pittori, e il 15 dicembre 1569 appare fra i Trenta del Consiglio, istituito quando i pittori furono distaccati dalle Quattro Arti e aggregati ai Bombasari (l'Arte dei lavoratori del cotone). Ebbe in più occasioni la carica di Massaro dell'Arte dei Bombasari e Pittori fino all'aprile 1585. E' probabile che alla fine dello stesso anno, o nel seguente, si fosse trasferito con tutta la famiglia a Milano, dove già si era stabilito il figlio Camillo, pittore.
L'artista bolognese entrò ovviamente a contatto con la pittura della tarda Controriforma emiliana (ad esempio Bartolomeo Cesi e Ludovico Carracci).
Muore a Milano nel 1595.